Universitas Wiralodra dipimpin oleh seorang Rektor yang didampingi beberapa Wakil Rektor. Wakil Rektor ini bertugas membatu Rektor dalam bidang Akademik, Keuangan, Kemahasiswaan, Alumni, Kerjasama, Humas. Pada masa bakti 2022-2026, susunan Pimpinan Universitas adalah sebagai berikut:
| No. | Jabatan | Pejabat | Pasfoto |
|---|---|---|---|
| 1. | Rektor | Dr. H. Ujang Suratno, S.H., M.Si. |  |
| 2. | Wakil Rektor Bidang Akademik (Wakil Rektor 1) | Dr. H. Dadun Kohar, M.Pd. |  |
| 3. | Wakil Rektor Bidang Keuangan (Wakil Rektor 2) | H. Pandu Sumarna, Ir., M.P. |  |
| 4. | Wakil Rektor Bidang Kemahasiswaan dan Alumni (Wakil Rektor 3) | Dr. H. Kambali, M.Pd.I |  |
Susunan Pimpinan Universitas pada masa-masa bakti sebelumnya adalah sebagai berikut:
- Masa Bakti 2018-2022
- Rektor: Dr. Ujang Suratno, SH., M.Si.
- Wakil Rektor 1: Dr. Dadun Kohar, M.Pd.
- Wakil Rektor 2: Dr. Asep Suherman, Ir., M.P.
- Wakil Rektor 3: Dr. H. Kambali, M.Pd.I
- Masa Bakti 2014-2018
- Rektor: Dr. Ujang Suratno, SH., M.Si.
- Wakil Rektor 1: Dr. Asep Suherman, Ir., M.P.
- Wakil Rektor 2: dr. H. Riyanto Martomijoyo, M.Kes.
- Wakil Rektor 3: H. Rusydi, Drs., M.M.
- Masa Bakti 2010-2014
- Rektor: Dr. Tohidin, Ir., M.P.
- Pembantu Rektor 1: Suwardi, M.Pd.
- Pembantu Rektor 2: Noerjanah Rahayuningsih, S.E., M.M.
- Pembantu Rektor 3: Dr. Murip Yahya, M.Pd.
- Masa Bakti 2006-2010
- Rektor: Dr. Tohidin, Ir., M.P.
- Pembantu Rektor 1: Suwardi, M.Pd.
- Pembantu Rektor 2: Daryono Setiadi, S.E., M.M., Noerjanah Rahayuningsih, S.E. (PAW 2008)
- Pembantu Rektor 3: Dr. Murip Yahya, M.Pd.
- Masa Bakti 2002-2006
- Rektor: Drs. Aan Juhana Senjaya, M.Pd., M.M.
- Pembantu Rektor 1: Nurjaman, S.E., M.M.
- Pembantu Rektor 2: Drs. Agus Yadi
- Pembantu Rektor 3: Drs. Edi Kusdiana, Hardi Saparudin, S.E. (PAW 2004)
- Masa Bakti 1998-2002
- Rektor: Drs. H. Abdul Halim PA, M.M.
- Pembantu Rektor 1: Drs. H. Moch. Sanusi
- Pembantu Rektor 2: Ir. Pandu Sumarna, M.P.
- Pembantu Rektor 3: Drs. Besar Heryanto, M.Si., Ir. Sugeng A. Achya (PAW 1999), Nurjaman, S.E., M.M. (PAW 2000)
- Masa Bakti 1994-1998
- Rektor: Drs. H. Abdul Halim PA, M.M.
- Pembantu Rektor 1: Drs. Helmi Sukardi
- Pembantu Rektor 2: Drs. H. Ridono Aidad
- Pembantu Rektor 3: Drs. H. Abas Kosim
- Masa Bakti 1990-1994
- Rektor: Drs. H. Abdul Halim PA (1990: Pymt, 1992: Definitif)
- Pembantu Rektor 1: Drs. Ate Subrata, Drs. Helmy Sukardi (PAW 1992)
- Pembantu Rektor 2: H. SM Sholichin, S.E., Drs. H. Herry Sudjati (PAW 1993)
- Pembantu Rektor 3: Drs. H. Ridono Aidad
- Masa Bakti 1986-1990
- Rektor: Drs. H. Prawoto Sayuti, Drs. H. RE. Soedarsono AR (PAW 1987)
- Pembantu Rektor 1: Drs. Zaenal Asikin
- Pembantu Rektor 2: Drs. H. Abdul Halim PA
- Pembantu Rektor 3: Drs. H. Ridono Aidad
- Masa Bakti 1982-1986
- Rektor: Drs. H. Prawoto Sayuti
- Pembantu Rektor 1: Drs. Slamet Rahardjo
- Pembantu Rektor 2: Drs. H. Abdul Halim PA
- Pembantu Rektor 3: Drs. H. Abas Kosim